Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5415E9PXF3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms