Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp54bE9PXC0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp54bE9PXC0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Srp54bE9PXC0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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