Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc8E9PWG2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms