Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp839E9PUU5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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