Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Soga1E1U8D0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Soga1E1U8D0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms