Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cngb1E1AZ71 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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