Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim12cD3Z3L3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms