Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm5930D3Z257 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5930D3Z257 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5930D3Z257 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5930D3Z257 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5930D3Z257 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5930D3Z257 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5930D3Z257 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5930D3Z257 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5930D3Z257 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5930D3Z257 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5930D3Z257 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5930D3Z257 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms