Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms