Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc8D3YZV8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc8D3YZV8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms