Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc6D3YZP9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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