Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6685D3YYP3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6685D3YYP3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6685D3YYP3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6685D3YYP3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6685D3YYP3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6685D3YYP3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6685D3YYP3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6685D3YYP3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6685D3YYP3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6685D3YYP3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6685D3YYP3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6685D3YYP3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms