Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd1D3YXK1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms