Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3259D3YUK0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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