Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms