Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD8

Mfap1a, Microfibrillar-associated protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1aC0HKD8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfap1aC0HKD8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms