Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Phf11bB4XVQ1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Phf11bB4XVQ1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phf11bB4XVQ1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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