Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cspp1B2RX88 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms