Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrt4B2RU40 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prrt4B2RU40 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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