Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zscan5bB2RTN3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms