Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brpf3B2KF05 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms