Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4930435E12RikA6X8Z9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930435E12RikA6X8Z9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms