Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm6880A3KG45 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm6880A3KG45 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6880A3KG45 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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