Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SktA2AQ25 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SktA2AQ25 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms