Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Syndig1A2ANU3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms