Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hivep3A2A884 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms