Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28490A0A087WRT9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm28490A0A087WRT9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm28490A0A087WRT9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm28490A0A087WRT9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm28490A0A087WRT9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28490A0A087WRT9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm28490A0A087WRT9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm28490A0A087WRT9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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