Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top3bQ9Z321 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top3bQ9Z321 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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