Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac5Q9Z2V6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac5Q9Z2V6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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