Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt85Q9Z2T6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt85Q9Z2T6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms