Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms