Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms