Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd2Q9Z2E1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms