Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HnrnpcQ9Z204 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HnrnpcQ9Z204 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms