Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3b1Q9Z1T1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.6 ms