Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx39bQ9Z1N5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddx39bQ9Z1N5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms