Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NgfrQ9Z0W1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms