Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacsin2Q9WVE8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pacsin2Q9WVE8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms