Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme3Q9WV85 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms