Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec2Q9WV35 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms