Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scnn1gQ9WU39 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms