Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp18Q9WTV6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp18Q9WTV6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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