Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cdh13Q9WTR5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdh13Q9WTR5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdh13Q9WTR5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdh13Q9WTR5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdh13Q9WTR5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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