Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Tubd1Q9R1K7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms