Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc3Q9R0B6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc3Q9R0B6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms