Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nek3Q9R0A5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek3Q9R0A5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms