Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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