Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ercc4Q9QZD4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms