Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VapbQ9QY76 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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