Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd4Q9QY39 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd4Q9QY39 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms